يستضيف القسم الإكلينيكي تعاليم العامين الرابع والخامس من الدورة البيطرية التي تؤدي إلى الحصول على دبلوم الطبيب البيطري.  

يوجد في القسم 38 معلمًا من ذوي الرتبة الممتازة يضمنون الإشراف التربوي للطلاب في الكراسي الأساسية للتخصص وفقًا لخصوصيات الأنواع الحيوانية ، بعد انتقالهم إلى قسم ما قبل السريرية الذي يسمح لهم بتجميع المعرفة اللازمة في العلوم الأساسية.  

لا يضع القسم الإكلينيكي لنفسه هدفًا يتمثل في تقديم تدريب أكاديمي عالي الجودة لطلابه. كما أنه يلعب دورًا في التدريب المهني للأطباء البيطريين المستقبليين من خلال العمل العملي والعيادات ، فضلاً عن الرحلات التعليمية المنظمة في إطار الاتفاقيات المبرمة بين معهد العلوم البيطرية والشركاء الاجتماعيين والاقتصاديين.  

لقد عمل القسم دائمًا منذ إنشاء المعهد من خلال تطوير التدريب في العلوم البيطرية بفضل جهود الإدارة والمعلمين. يشارك الأطباء والجراحون في التدريس في الدورة السريرية ، ويتم توفير المعدات المهنية ، وكذلك المواد الاستهلاكية الطبية للمتعلمين كل عام لتلبية احتياجاتهم التعليمية من حيث المعرفة والتقنية والوسائل.